Поступление членских взносов следует учитывать в составе прочих доходов учреждения.
Согласно п. 95 Инструкции по применению Плана счетов бухгалтерского учета автономных учреждений, утвержденной Приказом Минфина России от 23.12.2010 № 183н, прочие доходы учреждения отражаются на счете 020580000 "Расчеты по прочим доходам".
Поступление доходов в кассу учреждения отражается по дебету счета 220134000 "Касса" и кредиту счета 220580000 "Расчеты с плательщиками прочих доходов" (пп. 87, 97 Инструкции № 183н).